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超靈敏三重檢測(cè)法!IC-RPA-CRISPR/Cas12a技術(shù)筑牢水稻細(xì)菌性條斑病防控防線

水稻細(xì)菌性條斑病(BLS)作為由Xanthomonas oryzae pv. oryzicola(Xoc)引發(fā)的毀滅性病害,每年給全球水稻產(chǎn)業(yè)造成巨額產(chǎn)量損失,更是我國(guó)重點(diǎn)防控的檢疫性病害。傳統(tǒng)檢測(cè)技術(shù)始終存在諸多瓶頸:癥狀觀察與形態(tài)鑒定準(zhǔn)確率偏低,PCR技術(shù)依賴昂貴設(shè)備難以現(xiàn)場(chǎng)應(yīng)用,等溫?cái)U(kuò)增易出現(xiàn)假陽(yáng)性,血清學(xué)方法靈敏度不足,核酸提取過(guò)程還易受干擾。針對(duì)這些痛點(diǎn),一項(xiàng)發(fā)表于《Agricultural and Food Chemistry》的研究,創(chuàng)新開發(fā)出IC-RPA-CRISPR/Cas12a檢測(cè)方法,為水稻細(xì)菌性條斑病的精準(zhǔn)防控提供了全新解決方案。其中,研究中的CRISPR/Cas12a部分使用的正是我司提供的JY0301 CRISPR Cas12/13 HybriDetect試紙條。

該方法的核心創(chuàng)新在于將免疫捕獲、重組酶聚合酶擴(kuò)增(RPA)與CRISPR/Cas12a切割技術(shù)深度融合,構(gòu)建了“捕獲-擴(kuò)增-檢測(cè)”的高效閉環(huán)。檢測(cè)流程簡(jiǎn)潔高效:首先通過(guò)特異性Xoc單克隆抗體,在預(yù)涂抗體的PCR管壁上精準(zhǔn)捕獲目標(biāo)細(xì)菌,省去復(fù)雜核酸提取步驟;隨后在PCR管內(nèi)完成RPA核酸擴(kuò)增,快速放大目標(biāo)基因信號(hào);最后利用CRISPR/Cas12a特異性識(shí)別切割擴(kuò)增產(chǎn)物中的TTTN序列及ssDNA報(bào)告探針,通過(guò)信號(hào)讀取實(shí)現(xiàn)檢測(cè)。

更值得關(guān)注的是,該方法提供了三種靈活的讀數(shù)模式,適配不同應(yīng)用場(chǎng)景:qPCR機(jī)器可實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)定量檢測(cè),紫外燈能快速觀察熒光信號(hào),側(cè)流試紙條則支持現(xiàn)場(chǎng)可視化讀數(shù),無(wú)需復(fù)雜儀器。性能測(cè)試顯示,該方法特異性極強(qiáng),對(duì)7種Xoc菌株均能精準(zhǔn)識(shí)別,而對(duì)其他9種水稻病原菌無(wú)交叉反應(yīng);靈敏度更是實(shí)現(xiàn)質(zhì)的飛躍,qPCR模式檢測(cè)限低至2 CFU/mL,紫外燈模式為6 CFU/mL,側(cè)流試紙條模式為60 CFU/mL,較常規(guī)PCR和Dot-ELISA靈敏度提升256倍。

在實(shí)際應(yīng)用中,該方法表現(xiàn)同樣出色。對(duì)我國(guó)不同省份的9批水稻種子檢測(cè)結(jié)果,與PCR檢測(cè)完全一致,可準(zhǔn)確排查帶菌種子;針對(duì)田間采集的44份水稻葉片樣品,研究人員還開發(fā)了基于保溫杯和側(cè)流試紙條的無(wú)儀器檢測(cè)方案,操作簡(jiǎn)便且結(jié)果可靠,為田間現(xiàn)場(chǎng)快速檢測(cè)提供了可能。

這項(xiàng)集高靈敏度、強(qiáng)特異性、多場(chǎng)景適配于一體的檢測(cè)技術(shù),有效解決了水稻細(xì)菌性條斑病檢測(cè)的痛點(diǎn)難題,為病害早發(fā)現(xiàn)、早防控提供了有力支撐。未來(lái),隨著與微流控芯片等平臺(tái)的結(jié)合,該方法將進(jìn)一步提升檢測(cè)效率與便捷性,在水稻種子檢疫、田間病害監(jiān)測(cè)等實(shí)際生產(chǎn)場(chǎng)景中發(fā)揮更大作用,為保障糧食安全筑牢技術(shù)屏障。

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